Modh Grìogagan Magnetic a’ Fuasgladh Dhùbhlain ann an Tarraing DNA Uisge Àrainneachdail gu h-Èifeachdach
Ann an raointean leithid rannsachadh meanbh-bhitheòlas àrainneachdail agus sgrùdadh truailleadh uisge, tha toirt a-mach DNA genomic àrd-inbhe na riatanas deatamach airson tagraidhean sìos an abhainn a’ gabhail a-steach PCR/qPCR agus sreath-ghinealach an ath ghinealaich (NGS). Ach, tha sampallan uisge àrainneachdail gu math iom-fhillte, anns a bheil coimhearsnachdan meanbh-fhàs-bheairtean eadar-mheasgte, sreathan duilich an sgrùdadh leithid bacteria Gram-dheimhinneach, agus dùbhlain fad-ùine co-cheangailte ri dòighean às-tharraing traidiseanta - leithid cleachdadh ath-bheachdan puinnseanta agus modhan iom-fhillte - a tha air a bhith a’ cur dragh air luchd-rannsachaidh fad na h-ùine.
A-nis, tha Bigfish Sequencing a’ toirt a-steach an BFMP24R Magnetic Water Genomic DNA Extraction and Purification Kit, a bheir seachad fuasgladh coileanta do na dùbhlain sin tro theicneòlas ùr-ghnàthach agus dealbhadh furasta a chleachdadh.
Sealladh farsaing air an toradh
Tha an inneal seo stèidhichte air siostam bufair leasaichte còmhla ri grìogagan nano-mhagnaiteach àrd-choileanaidh. Bidh DNA genomic a’ ceangal gu sònraichte ri buidhnean gnìomh air uachdar a’ ghrìogag agus tha e air a sgaradh fo raon magnetach taobh a-muigh. Às deidh grunn cheumannan nighe socair gus pròtainean, salainn agus neo-chunbhalachdan eile a thoirt air falbh, tha DNA genomic àrd-ghlan air a dhì-ghalarachadh mu dheireadh.
Air a dhealbhadh gu sònraichte airson sampallan uisge àrainneachdail, bidh an inneal seo a’ toirt a-mach DNA bacteriach a chaidh a chruinneachadh air membranan sìoltachain gu h-èifeachdach, a’ gabhail a-steach bacteria Gram-àicheil agus Gram-dheimhinneach (suas ri 2 × 10⁹ ceallan bacteriach gach membran sìoltachain singilte). Tha e co-chòrdail ri siostaman às-tharraing searbhag niùclasach làn-fèin-ghluasadach airson giullachd àrd-toraidh. Tha an DNA a chaidh a thoirt a-mach de chàileachd cunbhalach agus faodar a chleachdadh gu dìreach airson PCR/qPCR, NGS, agus tagraidhean eile sìos an abhainn.
Feartan Bathar
1. Comas Tarraing Bacterial Speactram Farsaing
Bidh e a’ toirt a-mach bacteria Gram-àicheil agus Gram-dheimhinneach gu h-èifeachdach bho shamhlaichean uisge, a’ còmhdach choimhearsnachdan meanbh-bhitheach a lorgar gu cumanta ann an àrainneachdan uisge ùr agus mara, agus a’ coinneachadh ri riatanasan anailis eadar-mheasgte.
2. Glanachd Àrd agus Toradh Àrd
A’ lìbhrigeadh DNA le purrachd àrd, saor bho thruailleadh bacaidh, agus toradh seasmhach a tha freagarrach airson tagraidhean moileciuil dìreach sìos an abhainn.
3. Co-chòrdalachd fèin-ghluasadach agus àrd-èifeachdais
Gu tur co-chòrdail ri siostaman às-tharraing searbhag niuclasach fèin-ghluasadach Bigfish, a’ toirt taic do phròiseasadh aig an aon àm de 32 no 96 sampall, a’ lughdachadh ùine giollachd gu mòr agus a’ leasachadh èifeachdas obair-lann.
4. Obrachadh Sàbhailte agus Càirdeil don Chleachdaiche
Chan eil feum air ath-bheachdan organach puinnseanta leithid phenol no cloroform, a’ lughdachadh chunnartan sàbhailteachd obair-lann. Tha ath-bheachdan bunaiteach air am pacadh ro-làimh ann am pleitean 96-tobar, a’ lughdachadh mhearachdan pipette làimhe agus a’ sìmpleachadh sruthan-obrach.
Ionnsramaidean Co-chòrdail
Iasg Mòr BFEX-16E
BFEX-32
BFEX-32E
BFEX-96E
Toraidhean Deuchainneach
Chaidh sampall 600 mL de dh’uisge abhainn a shìoladh tro membran, agus chaidh DNA a thoirt a-mach le bhith a’ cleachdadh pasgan toirt a-mach is glanaidh DNA genomic uisge àrainneachdail stèidhichte air grìogagan magnetach Bigfish còmhla ris an inneal co-chòrdail. Chaidh an DNA a chaidh a thoirt a-mach a sgrùdadh às dèidh sin le electrophoresis gel agarose.
M: Comharra 1, 2: Sampallan uisge abhainn
Sònrachaidhean Bathar
Àm puist: 18 Dùbhlachd 2025
dealbh